Служба отвечает за ветеринарный контроль, включая обращение лекарственных средств для животных и защиту населения от болезней, общих для человека и животных. Также в её ведении находится карантин растений, защита сельхозкультур и безопасное использование пестицидов и агрохимикатов.
Отдельное направление работы — контроль качества и безопасности зерна и продуктов его переработки, а также обеспечение плодородия почв. Кроме того, ведомство регулирует вопросы, связанные с использованием земель сельскохозяйственного назначения и виноградопригодных территорий.
Россельхознадзор также следит за соблюдением требований к содержанию и использованию животных, в том числе в культурно-зрелищных целях, и контролирует соблюдение законодательства в сфере виноградарства и виноделия, за исключением аспектов лицензирования и оборота алкогольной продукции.
Таким образом, служба играет важную роль в обеспечении продовольственной безопасности, биологической защиты и контроля качества сельскохозяйственной продукции в стране.