Процедура банкротства «Фармации» была инициирована в декабре 2022 года по иску банка «Санкт-Петербург», которому компания задолжала около 100 млн рублей.
Иск был подан спустя полтора года после ареста Бориса и Евгении Шпигель по делу о коррупции. Следствие установило, что с июня 2019 по сентябрь 2020 года экс-губернатор Пензенской области Иван Белозерцев получил от Шпигеля взятку за заключение государственных контрактов с ОАО «Фармация».
25 января 2024 года Измайловский районный суд Москвы приговорил Бориса Шпигеля к 11 годам лишения свободы и штрафу свыше 450 млн рублей.
5 ноября 2025 года по ходатайству прокуратуры Шпигель был освобождён от дальнейшего отбывания наказания по состоянию здоровья и переведён из СИЗО «Матросская Тишина» в медицинское учреждение для госпитализации.